Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms