Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms