Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA5Q01523 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms