Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFAMQ00059 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms