Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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