Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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