Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms