Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms