Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPD2P43304 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPD2P43304 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPD2P43304 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms