Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms