Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms