Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGCXP38435 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GGCXP38435 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms