Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms