Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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CASQ1P31415 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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