Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MARCKSP29966 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms