Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms