Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NFKB1P19838 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NFKB1P19838 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NFKB1P19838 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKB1P19838 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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