Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms