Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VCLP18206 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VCLP18206 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VCLP18206 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms