Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCNAP12004 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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