Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms