Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms