Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAPGEF3O95398 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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