Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPFIA3O75145 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms