Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms