Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
COCHO43405 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms