Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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