Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PCH4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PCH4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms