Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms