Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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