Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms