Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms