Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms