Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms