Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms