Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms