Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms