Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms