Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms