Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBS2Q9BXC9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms