Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms