Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms