Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms