Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms