Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBGCP5Q96RT8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms