Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms