Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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