Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms