Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD6Q92537 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms