Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRNP3Q8WYN3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms